Während seiner Tätigkeit als Dirigent leitete Zdeněk Mácal mehr als 160 Orchester auf 4 Kontinenten, inklusive der meist prästigen (Boston, New York, Berlin, Wien). Dazu hat er an renommierten Festivals teilgenommen (Luzern, Tanglewood, Edinburgh, Wien, Montreux), und mit führenden Opernhäuser (Scala in Milano) zusammengearbeitet. Bemerkenswert ist die Realisierung zahlloser Tonaufzeichnungen die er im Laufe seiner Karriere als Dirigent vor allem für die Firmen Delos, Koss, Sony, EMI, Decca, Deutsche Grammophon oder Supraphon einspielte. In Jahren 1993 - 2002 stand er an der Spitze des New Yersey Symphony Orchestra. Im Jahr 2003 wurde er zum Chefdirigent der Tschechischen Philharmonie, die er bis 2008 leitete.